새만금 국제공항 건설을 둘러싼 조류충돌 위험성이 논란의 중심에 섰다. 새만금신공항 백지화공동행동은 "새만금신공항이 전국의 모든 공항과 신규 추진 공항을 통틀어 조류충돌 위험도가 가장 높다"고 주장하며 우려를 표명했다.

국토교통부의 새만금신공항 건설사업 전략환경영향평가서에 따르면, 새만금 국제공항 부지는 조류의 비행을 방해할 만한 건축물이 없이 장기간 관리되지 않은 초지로, 조류 및 야생동물들이 자유롭게 서식하고 있는 상태다.

이러한 환경에서 조사된 조류충돌 위험도는 절대적인 수치로 보기 어려우며, 군산공항과의 비교 분석이 필요하다는 점이 강조됐다.

또한 평가서에서는 군산공항의 조류충돌 위험도가 국내 15개 공항 중 세 번째로 낮게 평가됐으며, 무안공항보다도 조류충돌 위험이 낮은 것으로 예측됐다. 이는 새만금 국제공항의 위험도가 과장됐을 수 있음을 시사한다.

그러나 새만금신공항 백지화공동행동은 새만금신공항의 조류충돌 총 위험도가 무안공항보다 최대 610배 높다고 주장하며, 신공항 건설에 따른 환경적 영향을 면밀히 검토할 필요가 있다고 강조했다. 이로 인해 새만금 국제공항 건설에 대한 논란은 계속될 전망이다.